在生物医疗领域，蛋白Marker被广泛应用于蛋白质电泳和检测，主要分为未预染蛋白Marker和预染蛋白Marker两类。此外，还有其他类型的蛋白Marker，例如显影蛋白Marker等。

未预染蛋白Marker在电泳过程中无法观察，只有在电泳结束后通过染色才能显示其指示作用。尽管无法实时预示，但由于这些蛋白质没有附带染料分子或标记分子，它们的分子量正好反映了蛋白质的真实大小，因此被认为是最准确的选择。这种Marker通常由几种纯化后的蛋白通过共价耦联与染料混合，能够在电泳过程或转膜时直接观察到。

预染蛋白Marker则可分为单色预染和多色预染。一般来说，Marker条带越多，其参考价值越高，但同时也增加了区分的难度。若采用不同颜色的Marker，辨识就会更加简单；而单色Marker通常通过加倍某些条带的浓度来提示分子量。预染蛋白Marker可以在电泳过程中提供实时指示，当目标蛋白达到最佳分辨区域时，可以及时停止电泳以获取最佳结果。此外，在转膜过程中，预染蛋白Marker也可以用来监测转膜效率，并在膜上标记蛋白分子量。

需要注意的是，预染蛋白Marker与染料共价偶联后，在不同缓冲条件下，其电泳迁移特性可能发生变化，从而导致一定的偏差。这意味着，预染蛋白Marker条带反映的是相对大小，而非绝对大小。

显影蛋白Marker中通常含有IgG结合位点，能够结合检测目的蛋白的一抗或二抗，使该Marker能够与目标条带一起在印迹膜上显现。通常会设置两个预染条带，以便动态观察蛋白质的电泳状态，从而更好地判断转膜效果和方向。结合抗体后，通过化学发光检测可以显示多个条带。

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